<div dir="ltr"><br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">---------- Forwarded message ---------<br>From: <b class="gmail_sendername" dir="auto">irshad ul ala</b> <span dir="auto"><<a href="mailto:irshad.irshad.ulala4@gmail.com">irshad.irshad.ulala4@gmail.com</a>></span><br>Date: Mon, Jan 3, 2022 at 9:57 PM<br>Subject: Setting bathymetry for Internal wave simulation module | Irshad Ul Ala @Victoria University of Wellington<br>To:  <<a href="mailto:mitgcm-support@mitgcm.org">mitgcm-support@mitgcm.org</a>><br></div><br><br><div dir="ltr"><div>Hi again, <br></div><div><br></div><div>I am resending this email after having confirmed my subscription to the mailing list. I have made some edits accordingly below to my question.<br></div><div><br></div><div>My name is Irshad and I am a 5th year student in Victoria university of Wellington. I am currently working on a project that involves simulating internal waves, and was interested in seeing if the internal waves verification example in MITgcm could be edited to fit my particular bathymetry profile. <br></div><div><br></div><div>I have been referencing a section of the MITgcm examples at <a href="https://github.com/MITgcm/MITgcm/tree/master/verification/internal_wave">https://github.com/MITgcm/MITgcm/tree/master/verification/internal_wave</a>. I have been successful at running the simulation to output some resultant MSDIO files (meta./data. pairs) and changing the data file to simulate a longer time period. Having learned from reading about another example, if I understand correctly, I am to edit the data file within the input folder and change variable values for 'nTimeSteps' and 'monitorFreq' to 77760 and 12000. respectively for a 3 year long simulation. Hence, I went ahead and made those changes prior to printing out the output.<br></div><div><br></div><div>However, I have 3 general issues that I was hoping to get some help with : I do not know how to recreate the internal wave plot as shown in <b><a href="https://mitgcm.readthedocs.io/en/latest/overview/bound_forc_inter_waves.html#">https://mitgcm.readthedocs.io/en/latest/overview/bound_forc_inter_waves.html#</a></b> , I am not sure how to properly create an <b>animation </b>of the internal wave interacting with the bathymetry inputted for this example, and finally, I am not certain of an efficient way I could edit the topography in gendata.m such that I could use <a href="https://download.gebco.net/">https://download.gebco.net/</a> to import various different bathymetries into the internal wave model. I think I understand that gendata.m creates the file topog.slope which the model uses.<br></div></div><div dir="ltr"><br></div><div>Currently, I am able to import the various MSDIO pairs as variables, and import them into python using section 3.6.3.2 in <a href="https://mitgcm-example.readthedocs.io/en/latest/getting_started/getting_started.html">https://mitgcm-example.readthedocs.io/en/latest/getting_started/getting_started.html</a> .<br></div><div dir="ltr"><br><div>I apologise if I have made a grave misunderstanding in thinking this directory would be relevant to my project. If so, I am sorry for wasting your time. Any advice would be greatly appreciated.</div><div><br></div><div>Regards, <br></div><div>Irshad.<br></div></div>
</div></div>