<div dir="ltr"><div>Hi H. W. Shu<br></div><div><br></div><div>Those are gfortran symbols that the Intel (ifort) compiler is unable to find,</div><div>most likely when trying to link a library to the main MITgcm code.<br></div><div><br></div><div>If your MPI and netCDF libraries were compiled with gfortran,</div><div>or, which is more common, if you installed them from packages in your Linux distribution, <br></div><div>which normally compiles them with gfortran, it may be easier to try to use</div><div>a build_options file that uses gfortran instead of Intel ifort.</div><div>This is probably the shortest path to solve the problem.<br></div><div><br></div><div>If you prefer to use ifort, then a more laborious alternative is to compile MPI and netCDF</div><div>from scratch (i.e., download the MPI and netCDF source code and compile)  <br></div><div>with Intel icc and ifort, and use them to link the MITgcm.</div><div><br></div><div>I hope this helps,</div><div><br></div><div>Gus Correa<br> </div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Feb 9, 2021 at 1:50 AM H.W. Shu <<a href="mailto:shawn_chou@ees.hokudai.ac.jp">shawn_chou@ees.hokudai.ac.jp</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear MITgcm users, <br>
<br>
Hello, this is Shawn from Hokkaido University.<br>
We are trying compiling an mpi run in our system by default compiler in <br>
tools/build_options: linux_amd64_ifort<br>
(we added "-lmpi -03" in flags.)<br>
<br>
However, in the process of Make,<br>
it told us that "undefined reference to '_gfortran_st_write_done'" and " <br>
undefined reference to '_gfortran_transfer'".<br>
and leaved by this error. <br>
<br>
I am not familiar with compile problems, <br>
I will really appreciate if can get any hint to start to fix the problem.<br>
<br>
Thank you really much,<br>
<br>
Best regards,<br>
Shawn<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
MITgcm-support mailing list<br>
<a href="mailto:MITgcm-support@mitgcm.org" target="_blank">MITgcm-support@mitgcm.org</a><br>
<a href="http://mailman.mitgcm.org/mailman/listinfo/mitgcm-support" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.mitgcm.org/mailman/listinfo/mitgcm-support</a><br>
</blockquote></div>