<html xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style>
</head>
<body lang="EN-AU" link="blue" vlink="purple">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">I would have guessed that KPP is still required. With an aspect ratio of 1:200 this simulation should still be in the hydrostatic regime, despite the high resolution.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">If you have the computational resources you could try reducing dx and running a non-hydrostatic simulation without KPP.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">Cheers,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US">Ed<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:12.0pt;color:black">From: </span></b><span style="font-size:12.0pt;color:black">MITgcm-support <mitgcm-support-bounces@mitgcm.org> on behalf of Dimitris Menemenlis <dmenemenlis@gmail.com><br>
<b>Reply to: </b>"mitgcm-support@mitgcm.org" <mitgcm-support@mitgcm.org><br>
<b>Date: </b>Friday, 3 April 2020 at 05:53<br>
<b>To: </b>MITgcm Support <mitgcm-support@mitgcm.org><br>
<b>Subject: </b>Re: [MITgcm-support] [EXTERNAL] Banding, Checkerboarding in KPP Viscosities<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal">So I wonder if you need KPP turned on with such high resolution?<br>
<br>
> On Apr 2, 2020, at 11:06 AM, Senja Walberg <senja.w@gmail.com> wrote:<br>
> <br>
> Greetings,<br>
> <br>
> I have been conducting simulations of a lake and using KPP for vertical mixing. I encountered an issue of noise in derived |grad_h T| fields and traced it to checkerboarding in KPPdiffT and KPPviscA. Based on a 2004 discussion between Dimitris and Martin
 I found that the horizontal checkerboarding could be fixed by toggling on the KPP_SMOOTH_DENS flag in KPP_OPTIONS.h. However, I am still encountering vertical banding. Attached is a snapshot of this banding from a simplified lake simulation.<br>
> <KPPviscA_y_Support.jpg><br>
> The lake is stratified between ~25 degrees at the top and ~10 degrees at the bottom with the pycnocline at 15 m. I am using dz=0.5 m and dx=100m.<br>
> <br>
> I have tried turning on KPP_SMOOTH_VISC, KPP_SMOOTH_DIFF, and ALLOW_KPP_VERTICALLY_SMOOTH, as well as increasing both horizontal and vertical viscosities and diffusivities, and have had no luck getting rid of this banding.<br>
> <br>
> I'm currently experimenting with changing the vertical resolution to see what effect that has, but would like to not be constrained to a coarse vertical grid if there is some fix to this.<br>
> <br>
> Does anybody know what's causing this issue or how it can be resolved? <br>
> <br>
> Regards,<br>
> Senja<br>
> _______________________________________________<br>
> MITgcm-support mailing list<br>
> MITgcm-support@mitgcm.org<br>
> <a href="http://mailman.mitgcm.org/mailman/listinfo/mitgcm-support">
http://mailman.mitgcm.org/mailman/listinfo/mitgcm-support</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
MITgcm-support mailing list<br>
MITgcm-support@mitgcm.org<br>
<a href="http://mailman.mitgcm.org/mailman/listinfo/mitgcm-support">http://mailman.mitgcm.org/mailman/listinfo/mitgcm-support</a><br>
<br>
<o:p></o:p></p>
</div>
<p style="font-size:10pt; line-height:10pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><br>
<br>
University of Tasmania Electronic Communications Policy (December, 2014). <br>
This email is confidential, and is for the intended recipient only. Access, disclosure, copying, distribution, or reliance on any of it by anyone outside the intended recipient organisation is prohibited and may be a criminal offence. Please delete if obtained
 in error and email confirmation to the sender. The views expressed in this email are not necessarily the views of the University of Tasmania, unless clearly intended otherwise.
</p>
</body>
</html>