<div dir="ltr">Thanks for the reply Martin,<div><br><div>I suppose something I neglected to mention is that the simulation contains a full lake and so there are very shallow areas of the bathymetry, hence I believe that the partial cells are draining and that's why the eta value is less than dz. I'll be sure to follow your advice of using a more smoothly varying vertical grid. For now, it seems that running a version with a minimum depth (truncating the shoreline areas down) worked to solve my issue. </div><div><br></div><div>Regards</div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">Senja</div></div></div></div>